Table 1 List of primers used for PCR amplification
Target gene | Primer sequences (5′ → 3′) | Product size (bp) |
|---|---|---|
rpoB | 5ʹ- CAACGGTGTGGTTACTGACG-3ʹ 5ʹ- TCTACGAAGTGGCCGTTTTC-3ʹ | 108 |
blaIMP | 5ʹ- TGAGCAAGTTATCTGTATTC -3ʹ 5ʹ- TTAGTTGCTTGGTTTTGATG -3ʹ | 740 |
blaVIM | 5ʹ- GATGGTGTTTGGTCGCATA-3ʹ 5ʹ- CGAATGCGCAGCACCAG-3ʹ | 390 |
blaNDM | 5ʹ- GGTTTGGCGATCTGGTTTTC-3ʹ 5ʹ- CGGAATGGCTCATCACGATC-3ʹ | 621 |
blaOXA-48 | 5ʹ- TTGGTGGCATCGATTATCGG-3ʹ 5ʹ- GAGCACTTCTTTTGTGATGGC-3ʹ | 428 |
treC | 5ʹ- CCGACAGCGGGCAGTATT -3ʹ 5ʹ- CGCCGGATTCTCCCAGTT-3ʹ | 71 |
wza | 5ʹ- CGACAGTGAATGCGTCATT-3ʹ 5ʹ- TGACTGGCTTCCTGATGC-3ʹ | 309 |
luxS | 5′- GCCGTTGTTAGATAGTTTCACAG -3' 5′- CAGTTCGTCGTTGCTGTTGATG -3' | 447 |