Table 1 The specificity of Real-GP®, -GN®, and -CAN® real-time PCR assays for 62 bacterial and 25 fungal reference strains

Gram-positive bacteria

Staphylococcus

S. aureus

29213

26.59

UD

UD

S. aureus

25923

28.42

UD

UD

S. xylosus

29971

20.81

UD

UD

Enterococcus

E. hirae

9790

26.31

UD

UD

E. raffinosus

49427

28.09

UD

UD

E. sulfureus

49903

28.40

UD

UD

E. durans

19432

23.48

UD

UD

E. casseliflavus

700327

25.98

UD

UD

E. faecium

19434

26.72

UD

UD

E. faecalis

29212

25.33

UD

UD

E. mundtii

43186

29.90

UD

UD

E. cecorum

43198

21.68

UD

UD

E. flavescens

49997

22.21

UD

UD

E. gallinarum

49573

23.88

UD

UD

E. faecalis

51299

24.10

UD

UD

E. solitarius

49428

30.44

UD

UD

E. faecium

35667

24.66

UD

UD

E. malodoratus

43197

27.02

UD

UD

E. saccharolyticus

43076

23.06

UD

UD

E. casseliflavus

25788

26.28

UD

UD

Streptococcus

S. pneumoniae

49619

21.11

UD

UD

S. agalactiae

13813

26.41

UD

UD

Micrococcus

M. luteus

49732

22.36

UD

UD

Mycobacterium

M. avium

25291

23.06

UD

UD

M. chelonae

35749

21.34

UD

UD

M. gastri

15754

23.90

UD

UD

M. kansasii

12478

22.17

UD

UD

M. nonchromogenicum

19530

18.31

UD

UD

M. phlei

11758

25.09

UD

UD

M. smegmatis

19420

24.40

UD

UD

M. triviale

23292

22.66

UD

UD

M. aurum

23366

24.83

UD

UD

M. farcinogen

35753

20.00

UD

UD

M. gilvum

43909

19.40

UD

UD

M. neoaurum

25795

17.83

UD

UD

M. parafortuitum

19686

19.06

UD

UD

M. peregrinum

14467

18.57

UD

UD

M. septicum

700731

23.47

UD

UD

M. abscessus

19977

21.73

UD

UD

Gram-negative bacteria

Escherichia

E. coli

25922

UD

20.46

UD

E. coli

35218

UD

17.90

UD

Enterobacter

E. aerogenes

1304

UD

19.09

UD

Citrobacter

C. freundii

6750

UD

14.19

UD

Shigella

S. boydii

DML 399

UD

25.59

UD

S. dysenteriae

DML 400

UD

18.38

UD

S. flexneri

9199

UD

21.82

UD

Serratia

S. liquifaciens

27952

UD

24.96

UD

Salmonella

S. typhi

19430

UD

16.54

UD

S. enteritidis

13076

UD

20.15

UD

S. paratyphi

11511

UD

19.61

UD

S. typhimurium

13311

UD

16.19

UD

S. newport

6962

UD

17.22

UD

Klebsiella

K. pneumoniae

13883

UD

20.60

UD

K. oxytoca

700324

UD

21.87

UD

Proteus

P. alcalifaciens

51902

UD

18.38

UD

P. vulgaris

49132

UD

17.13

UD

P. mirabilis

49132

UD

16.34

UD

Pseudomonas

P. cepacia

25608

UD

19.66

UD

P. aeruginosa

27853

UD

16.57

UD

Haemophilus

H. influenzae

49247

UD

18.61

UD

Leclercia

L. adecarboxylata

23216

UD

15.70

UD

Bordetella

B. bronchiseptica

10580

UD

19.44

UD

Fungi

Penicillium

P. camemberti

58608

UD

UD

UD

P. paneum

KACC 44823

UD

UD

UD

Aspergillus

A. oryzae var oryzae

KACC 44847

UD

UD

UD

A. oryzae var. effusus

1010

UD

UD

UD

A. clavatus

66443

UD

UD

UD

A. sydowii

KACC 41869

UD

UD

UD

A. fumigatus

KCMF 10773

UD

UD

UD

A. flavus

KCMF 10777

UD

UD

UD

A. tamari

20054

UD

UD

UD

Fusarium

F. acuminatum

10466

UD

UD

UD

Aureobasidium

A. pullulans

KACC 41291

UD

UD

UD

Bipolaris

B. sorokiniana

KACC 44841

UD

UD

UD

Cryptococcus

C. neoformans

KCMF 20047

UD

UD

UD

Kodamea

K. ohmeri

KCMF 20430

UD

UD

UD

Saccaromyces

S. cerevisiae

KCMF 50427

UD

UD

UD

Trichophyton

T. rubrum

KCMF 10444

UD

UD

UD

T. mentagrophytes

KCMF 10515

UD

UD

UD

Microsporum

M. canis

KCMF 10531

UD

UD

UD

Epidermophyton

E. floccosum

52063

UD

UD

UD

Malassezia

M. furfur

KCMF 20409

UD

UD

UD

Candida

C. albicans

36802

UD

UD

26.42

C. tropicalis

14506

UD

UD

25.98

C. glabrata

38326

UD

UD

17.09

C. parapsilosis

7330

UD

UD

24.27

C. krusei

20298

UD

UD

19.67