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Table 4 Virulome of the ESBL-producing ExPEC strains

From: Population snapshot of the extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli invasive strains isolated from a Hungarian hospital

Virulence genes

Isolate

Ec1

Ec2

Ec3

Ec4

Ec5

Ec6

Adhesins

fimA

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimB

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimC

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimD

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimE

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimF

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimG

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimH

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fimI

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

sfaX

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

mat operon

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

iha

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

crl

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

csg operon

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

Invasine

aslA

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

kpsD

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

kpsM

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

kpsT

     

 + 

ibeB

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

usp

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

Iron uptake

chuA

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

chuS

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

chuT

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

chuU

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

chuV

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

chuW

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

chuX

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

chuY

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

sitA

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

sitB

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

sitC

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

sitD

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

fyuA

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

iutA

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

iucA

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

iucB

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

iucC

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

irp2

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

iroB

 

 + 

    

iroC

 

 + 

    

iroD

 

 + 

    

iroE

 

 + 

    

iroN

 

 + 

    

Protectins/serum resistance

ompT

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

iss

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 

Bor

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 

gad

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

traT

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

traD

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 

neuA

     

 + 

neuC

     

 + 

Toxins

astA

 + 

 + 

 + 

   

sat

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

 + 

vat

     

 + 

senB

 + 

 

 + 

 + 

 

 + 

hlyF

 

 + 

    

Virotype

C

B

C

C

C

NA

  1. The table includes all virulence genes present in at least one isolate. The + indicates the presence of a gene. NA: not applicable. The Ec1, Ec3, Ec3 correspond to ST131 C2/H30Rx isolates, Ec4, Ec5 correspond to ST131 C1-M27 isolates Ec6 corresponds to ST1193 isolate