|
Serotype
|
Sample
|
tetM
|
tetO
|
tetK
|
tetL
|
ermA
|
ermB
|
ermC
|
ermM
|
ermTR
|
mefA
|
mefE
|
lnuB
|
Resistance summary
|
D test
|
|---|
|
III
|
13
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
TET, FQNS, cMLSB
|
/
|
|
III
|
18
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
TET, FQNS, cMLSB
|
/
|
|
III
|
27
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
TET, FQNS, cMLSB
|
/
|
|
III
|
1
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
+
|
TET, FQNS, cMLSB
|
/
|
|
V
|
26
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
−
|
+
|
−
|
+
|
+
|
TET, FQNS, cMLSB
|
/
|
|
Ib
|
8
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
+
|
TET, cMLSB
|
/
|
|
Ib
|
24
|
+
|
−
|
+
|
+
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
TET, cMLSB
|
/
|
|
Ia
|
3
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET, cMLSB
|
/
|
|
III
|
14
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET, FQNS, MS
|
Negative
|
|
V
|
17
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
+
|
−
|
TET, FQNS, iMLSB
|
Positive
|
|
V
|
10
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
+
|
−
|
TET, FQNS, iMLSB
|
Positive
|
|
Ib
|
4
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
FQNS, cMLSB
|
/
|
|
Ib
|
22
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
FQNS, cMLSB
|
/
|
|
Ib
|
15
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
CLI, FQNS
|
/
|
|
III
|
11
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET, iMLSB
|
Positive
|
|
Ia
|
16
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET, MS
|
Negative
|
|
Ia
|
2
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET, MS
|
Negative
|
|
III
|
6
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET, MS
|
Negative
|
|
Ia
|
5
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET, CLI
|
/
|
|
Ib
|
7
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
FQNS
|
/
|
|
III
|
9
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
+
|
FQNS
|
/
|
|
Ia
|
23
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET
|
/
|
|
V
|
25
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
TET
|
/
|
|
V
|
19
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET
|
/
|
|
V
|
21
|
+
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
TET
|
/
|
|
VI
|
12
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
/
|
|
VI
|
20
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
−
|
/
|
|
Total number
|
18
|
3
|
1
|
1
|
0
|
10
|
0
|
0
|
3
|
0
|
9
|
8
| | |
- The order was sorted based on Additional file 1: Table S6. Tet genes are resistant to tetracycline; erm genes are resistant to clindamycin, erythromycin and streptogramin_b; mef genes are resistant to erythromycin; lnuB gene is resistant to clindamycin. Erythromycin is a kind of macrolides; clindamycin a kind of lincosamides
- TET tetracycline, CLI clindamycin, E erythromycin, FQNS fluoroquinolones. cMLS
B
constitutive resistance to macrolides, lincosamides, and streptograminB, iMLS
B
inducible resistance to macrolides, lincosamides, and streptograminB, MS resistance to macrolides and susceptibility to lincosamides
