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Table 1 Comparison of the genetic characteristics of the carbapenemase genes in A. baumannii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacteriaceae isolates and the activity of the respective enzymes and detection of imipenem hydrolysis by use of MALDI-TOF-MS directly from solid culture media and directly from positive blood culture vials

From: MALDI-TOF MS based carbapenemase detection from culture isolates and from positive blood culture vials

Bacterial isolates

Enzyme variants

Ambler classification

Carbapenemase variants—genotyped

MALDI-TOF MS-based imipenem hydrolysis assay

Solid culture media

 A. baumannii

B (= 9)

NDM-1a (n = 7)

(n = 7)

GIM-1 (n = 1)

(n = 1)

VIM-2 (n = 1)

(n = 1)

 A. baumannii

D (n = 29)

OXA-23 (n = 19)

(n = 19)

OXA-40 (n = 1)

(n = 1)

OXA-58 (n = 3)

(n = 3)

OXA-72 (n = 4)

(n = 3)

OXA-164 (n = 2)

(n = 2)

 E. coli

A (n = 2)

KPC-2 (n = 2)

(n = 2)

 K. pneumoniae

A (n = 3)

KPC-3 (n = 3)

(n = 3)

 E. cloacae

B (n = 2)

IMP-4, IMP-14 (n = 2)

(n = 2)

 S. marcescens

B (n = 1)

IMP-13

(n = 1)

 E. cloacae

B (n = 1)

NDM-1a (n = 1)

(n = 1)

 E. coli

B (n = 2)

NDM-1a, -3 (n = 2)

(n = 2)

 K. pneumoniae

B (n = 1)

NDM-1a (n = 1)

(n = 1)

 K. pneumoniae

B (n = 2)

VIM-2 (n = 2)

(n = 2)

 K. oxytoca

B (n = 1)

VIM-1, (n = 1)

(n = 1)

 E. cloacae

B (n = 1)

VIM-4 (n = 1)

(n = 1)

 P. aeruginosa

B (n = 2)

VIM-2 (n = 2)

(n = 2)

 K. pneumoniae

D (n = 4)

OXA-48 (n = 4)

(n = 4)

 C. freundii

D (n = 1)

OXA-162 (n = 1)

(n = 1)

 E. coli

D (n = 1)

OXA-181 (n = 1)

(n = 1)

 K. pneumoniae

D (n = 1)

OXA-204 (n = 1)

(n = 1)

Blood culture vials

 A. baumannii

B (n = 9)

NDM-1a (n = 7)

(n = 2)

GIM-1 (n = 1)

(n = 1)

VIM-2 (n = 1)

None

 A. baumannii

D (n = 29)

OXA-23 (n = 19)

(n = 15)

OXA-40 (n = 1)

None

OXA-58 (n = 3)

(n = 3)

OXA-72 (n = 4)

(n = 3)

OXA-164 (n = 2)

None

 E. coli

A (n = 2)

KPC-2 (n = 2)

(n = 2)

 K. pneumoniae

A (n = 3)

KPC-3 (n = 3)

(n = 3)

 E. cloacae

B (n = 2)

IMP-4, IMP-14 (n = 2)

(n = 2)

 S. marcescens

B (n = 1)

IMP-13

(n = 1)

 E. cloacae

B (n = 1)

NDM-1a (n = 1)

(n = 1)

 E. coli

B (n = 2)

NDM-1a, −3 (n = 2)

(n = 2)

 K. pneumoniae

B (n = 1)

NDM-1a (n = 1)

(n = 1)

 K. pneumoniae

B (n = 2)

VIM-2 (n = 2)

(n = 2)

 K. oxytoca

B (n = 1)

VIM-1, (n = 1)

(n = 1)

 E. cloacae

B (n = 1)

VIM-4 (n = 1)

(n = 1)

 P. aeruginosa

B (n = 2)

VIM-2 (n = 2)

(n = 2)

 K. pneumoniae

D (n = 4)

OXA-48 (n = 4)

(n = 3)

 C. freundii

D (n = 1)

OXA-162 (n = 1)

(n = 1)

 E. coli

D (n = 1)

OXA-181 (n = 1)

(n = 1)

 K. pneumoniae

D (n = 1)

OXA-204 (n = 1)

(n = 1)

  1. aNDM-1/-6