Serogroup | Target gene | Primer name | Primer sequence (5’-3’) | Size of product (bp) |
---|---|---|---|---|
O1 | wzx | wl-14632 | GTGAGCAAAAGTGAAATAAGGAACG | 1098 |
 |  | wl-14633 | CGCTGATACGAATACCATCCTAC |  |
O6 | wzy | wl-14646 | GGATGACGATGTGATTTTGGCTAAC | 783 |
 |  | wl-14647 | TCTGGGTTTGCTGTGTATGAGGC |  |
O7 | wzx | wl-14648 | CTATCAAAATACCTCTGCTGGAATC | 610 |
 |  | wl-14649 | TGGCTTCGAGATTAAACCTATTCCT |  |
O8 | orf469 | wl-14652 | CCAGAGGCATAATCAGAAATAACAG | 448 |
 |  | wl-14653 | GCAGAGTTAGTCAACAAAAGGTCAG |  |
O16 | wzx | wl-14654 | GGTTTCAATCTCACAGCAACTCAG | 302 |
 |  | wl-14655 | GTTAGAGGGATAATAGCCAAGCGG |  |
O21 | wzx | wl-14676 | CTGCTGATGTCGCTATTATTGCTG | 209 |
 |  | wl-14677 | TGAAAAAAAGGGAAACAGAAGAGCC |  |
O75 | wzy | wl-17413 | GAGATATACATGGGGAGGTAGGCT | 511 |
 |  | wl-17414 | ACCCGATAATCATATTCTTCCCAAC |  |
O2 | wzy | wl-14636 | AGTGAGTTACTTTTTAGCGATGGAC | 770 |
 |  | wl-14637 | AGTTTAGTATGCCCCTGACTTTGAA |  |
O4 | wzx | wl-14642 | TTGTTGCGATAATGTGCATGTTCC | 664 |
 |  | wl-14643 | AATAATTTGCTATACCCACACCCTC |  |
O15 | wzy | wl-14672 | TCTTGTTAGAGTCATTGGTGTATCG | 183 |
 |  | wl-14673 | ATAAAACGAGCAAGCACCACACC |  |
O18 | wzx | wl-14656 | GTTCGGTGGTTGGATTACAGTTAG | 551 |
 |  | wl-14657 | CTACTATCATCCTCACTGACCACG |  |
O22 | wzx | wl-14660 | TTCATTGTCGCCACTACTTTCCG | 468 |
 |  | wl-14661 | GAAACAGCCCATGACATTACTACG |  |
O25 | wzy | wl-14666 | AGAGATCCGTCTTTTATTTGTTCGC | 230 |
 |  | wl-14667 | GTTCTGGATACCTAACGCAATACCC |  |
O83 | wzx | wl-14668 | GTACACCAGGCAAACCTCGAAAG | 362 |
 |  | wl-14669 | TTCTGTAAGCTAATGAATAGGCACC |  |
E. coli | 16SrRNA | wl-3110 | AGAGTTTGATCMTGGCTCAG | 919 |
 |  | wl-3111 | CCGTCAATTCATTTGAGTTT |  |